В 1958 году стоматологический факультет в Читинском государственном медицинском институте впервые открыл свои двери будущим врачам-стоматологам. Становление факультета проходило под руководством ректора Ю.Д. Рыжкова и доцента С.И. Рассудова. С 20 июня 1960 г. организована кафедра терапевтической стоматологии (ныне возглавляет кафедру к.м.н., доцент Кукушкин В.Л.), первый заведующий - доцент, к.м.н. Царинский М.М. который стал и первым деканом факультета (1962 - 1965 гг.), при его участии в 1963 г. открыта стоматологическая клиника на базе которой разместились профильные кафедры. В эти годы на факультете создается учебно-методическая документация, укрепляется материально-техническая база кафедр, готовятся высококвалифицированные научные кадры. Создается курс ортопедической стоматологии (1960 г., первый заведующий – майор медслужбы Поважный В.Г.), в последующем перепрофилирован в одноименную кафедру, которую возглавил с 1966 г. к.м.н. Г.И. Назаров, с 2002 г. и по ныне возглавляет кафедру д.м.н., профессор Писаревский Ю.Л.
Царинского М.М. на должности декана факультета сменил хирург В.А. Любарский (1965-1970 гг.). В последующие 5 лет (1970-1974) декан факультета - Ф.Е. Власюк. К этому времени большинство преподавателей имело ученую степень и научные звания, факультет стал лечебным и методическим центром для стоматологов области. В 1972 г. развернуты научные исследования по эпидемиологии стоматологических заболеваний в Забайкалье, оценке состояния систем гемостаза и иммунитета при челюстно-лицевой травме, объединённые в одну научную проблему, исполнителями которой стало большинство преподавателей факультета. В период с 1979 по 1984 гг. декан факультета - доцент Ю.С. Бояров В эти годы (1980 г.) организуется курс хирургической стоматологии под руководством к.м.н., доцента, подполковника медицинской службы В.А. Любарского, с 1988 г. и до августа 2022 г. кафедру возглавлял Пинелис И.С., с сентября 2022 г. на этом посту сменил его сын и ученик Пинелис Ю.И.
В 1983 году формируется курс стоматологии детского возраста, его возглавила к.м.н. Г.И. Фролова, в последующим преобразован в одноименную кафедру (первый заведующий - к.м.н. С.Н. Постоюк), ныне кафедру возглавляет к.м.н., доцент А.М. Петрова.
С 1985 по 1988 гг. факультетом руководил доцент Э.А. Раднаев, при нем набор студентов на стоматологический факультет увеличился до 125 человек. Событием для факультета стала первая защита докторской диссертации в 1988 г. ассистентом кафедры хирургической стоматологии И.С. Пинелисом, который в последующем и до 2007 г. возглавлял факультет; при его инициативе в 1990 г. открыта аспирантура по стоматологии, которую успешно окончили многие преподаватели факультета. За последние 22 года защищено 5 докторских более 40 кандидатских диссертаций. Кроме развития научного направления, эти годы характеризовались перестройкой в Высшей школе, переходом на многоуровневую подготовку специалистов, неоднократной сменой учебных планов и программ, а как следствие переработкой всей учебно-методической документации. Одновременно с ростом научных кадров все больше повышалась роль факультета в развитии практической стоматологии. Преподаватели факультета непосредственно участвовали в освоении новых лечебных учреждений города, в которые они внедряли новейшие методы лечения, оперативной техники и ортопедии. С 1992 года на факультете одновременно с клинической ординатурой и аспирантурой стали осуществлять последипломное повышение квалификации врачей стоматологов Забайкальского края, Амурской области, республик Бурятия и Якутия. В 1998 году сформирована кафедра стоматологии факультета повышения квалификации врачей (заведующий – к.м.н., доцент В.В. Зобнин).
В 2007 г. на должность декана факультета избран к.м.н. Шаповалов А.Г., в настоящее время возглавляющий клинику академии – основную учебную базу факультета. С 2009 по 2012 гг. декан факультета - заведующая кафедрой стоматологии детского возраста, д.м.н. Попова Е.С., ведущий специалист по лечению аномалий и деформаций прикуса у детей, подростков и взрослых. С 2012 по 2015 гг. декан факультета - заведующий курсом пропедевтики стоматологических заболеваний, к.м.н., доцент Кузнецов И.А. С 2015 по 2018 гг. должность декана факультета занимает д.м.н., доцент Зайцев Д.Н., ныне ректор Читинской медицинской академии.
В настоящее время декан факультета – д.м.н., доцент Мироманова Н.А.
Функцию помощника декана по воспитательной работе долгое время выполняла доцент, к.м.н., доцент кафедры терапевтической стоматологии с курсом пропедевтики стоматологических заболеваний Сандакова Д.Ц., в 2021 году ее сменила к.м.н., доцент Малежик М.С.
За свою историю факультете подготовил более 5000 врачей-стоматологов, из них более 200 студентов получили дипломы с отличием. Выпускники факультета трудятся на территории всей России и далеко за ее пределами, составляют основной преподавательский состав профильных кафедр факультета, являются главными специалистами в своих областях. В настоящее время на факультете работает 3 профессора, 19 кандидатов медицинских наук. Коллектив факультета постоянно работает над улучшением качества подготовки молодых специалистов и повышением уровня стоматологической помощи в Забайкалье.