Создание научной библиотеки произошло вместе с открытием первого в Забайкалье медицинского института в 1953 г. Для библиотеки было предоставлено отдельное здание,  передано оборудование, учебная и научная литература бывшего Пермского медицинского стоматологического института, а также была прислана научная литература из Центральной медицинской библиотеки. Первоначально библиотечный фонд составлял 25 300 экземпляров книг и журналов, а библиотека состояла из книгохранилища с пунктом выдачи и читальным залом на 15 мест.

1962 год стал для библиотеки знаменательным. Она была переведена в главный корпус медицинского института по ул. Горького, 39 а, где было предоставлено большое помещение с оборудованным книгохранилищем, абонементом, читальным залом, справочно-библиографический отделом, отделом комплектования и обработки литературы. В 1967 г. для студентов первых трех курсов лечебного и стоматологического факультетов  в общежитии №4 был открыт абонемент учебной литературы младших курсов. В те годы в библиотеке работали заведующая библиотекой О.М. Пономарь, библиотекари К.П. Пчелинцева, В.В. Шитикова, Л.В. Перевозникова, Э.С. Ядрышникова, библиограф Т.Г.Полетаева, З.Д. Голобокова.

В начале 70-х годов прошлого века, библиотека медицинского института находилась в левом крыле главного учебного корпуса, в его цокольном этаже. Там размещались почти все подразделения библиотеки. В книгохранилище все полки вплотную были заставлены научной медицинской литературой, изданиями по смежным наукам, художественной литературой, научными медицинскими журналами, авторефератами диссертаций. Из-за отсутствия места на полках, учебники размещались огромными кипами в торце стеллажей или в промежутках между стеллажами, вплотную к стене. Творческая и дружелюбная обстановка в коллективе, вместе с тем, высокая требовательность в работе сделали библиотеку уважаемой и  любимой читателями. Студенты и молодые аспиранты, профессора и преподаватели – все получали здесь квалифицированную помощь. Любая научная или учебная работа – подготовка к занятиям и экзаменам, написание статьи, работа над диссертацией – не обходилась без помощи библиотекарей и библиографов.

Заведовала библиотекой в течение  34 лет Ольга Михайловна Пономарь. Под руководством О.М. Пономарь, библиотека шаг за шагом укрепляла материально-техническую базу, совершенствовала библиотечно-библиографическое обслуживание читателей, закладывала фундамент для дальнейшего развития. На протяжении многих лет О.М. Пономарь руководила Областным методическим центром библиотек высших учебных заведений. Кроме того она выполняла функции члена Зонального Совета при научной библиотеке Иркутского Государственного Университета. Спокойную и рассудительную О.М. Пономарь дополняла её заместитель – энергичная и фонтанирующая идеями Зоя Дмитриевна Голобокова. Много времени и сил она уделяла методической работе, повышению квалификации библиотечных кадров. Курировавшая в течение многих лет справочно-библиографический отдел, она внесла большой вклад в работу по выпуску библиографических указателей и составлению картотеки. С приходом в 1972 г. в библиотеку Зои Васильевны Косьяненко, начинается становление культурно-массовой работы. Яркий и талантливый человек, педагог по образованию, она совмещала работу по обслуживанию читателей научного абонемента с организацией и проведением диспутов, литературных вечеров, читательских конференций. В 1984 г. организован сектор культурно-массовой работы. В библиотеке впервые составляется и проводится Перспективный план массовой работы. В 70-е годы штат библиотеки пополнился молодыми, энергичными, образованными сотрудниками: Т.П. Трухина, О.В. Вершинина, С.Н. Ермакова – людьми, которые посвятили себя библиотечной работе на протяжении более 40 лет. Они придали развитию библиотеки импульс, стали руководителями и организаторами основных направлений библиотечной работы.

В 70-е–80-е гг.  библиотека активно развивается. Создается библиотечный совет, который многие годы работал под руководством доцента Ю.И. Алексенко, заведующего кафедрой внутренних болезней стоматологического факультета, идет активное комплектование фонда. Ежегодно приобреталось около 16 тысяч экземпляров книг, 268 названий отечественной и иностранной периодики, в том числе реферативные журналы и даже валютные «Index Medicus» и «Current Contex». В 1974 г. фонд библиотеки насчитывал 235 тысяч томов книг, периодических изданий, авторефератов, микропленок и являлся крупнейшим хранилищем медицинской литературы Читинской области. В 1974 г. принято решение о перемещении части подразделений отдела обслуживания в новое общежитие №1. Там были открыты учебный абонемент старших курсов, студенческий читальный зал с подсобным фондом и художественный абонемент. Наряду с развитием традиционных, постепенно осваивались и внедрялись новые формы и методы работы: дифференцированное обслуживание читателей, безынвентарный учет многоэкземплярной литературы, создана картотека книгообеспеченности учебного процесса, проводились «Дни информации», «Дни кафедр», читались лекции по библиографии для студентов и аспирантов. Уделялось огромное внимание повышению профессиональной квалификации кадров. Сотрудники библиотеки имели возможность знакомиться с новыми методами работы, участвовать во всесоюзных, зональных конференциях и семинарах, обучаться на факультете повышения квалификации Московского института культуры, в библиотеке проводились обучающие занятия для новых сотрудников, преподаватели института читали лекции по медицинской, фармацевтической, биологической терминологии для библиотекарей. Большое значение в те годы придавалось наставничеству. Наставниками в те годы являлись О.М. Пономарь, З.Д. Голобокова, Л.В. Перевозникова, К.П. Пчелинцева. Активно работал межбиблиотечный абонемент, библиотека ЧГМИ поддерживала связь с 22 крупнейшими библиотеками страны и по просьбе читателей могла выписать во временное пользование любую книгу, журнал или их копию. Развитие культурно-массовой работы в библиотеке в те годы неразрывно связано с В.И. Новоселовой, работающей в библиотеке с 1987 г. Одарённый человек, энтузиаст библиотечной работы Валентина Ивановна активизировала это направление работы, успешно проводила большую массовую работу: литературные вечера, читательские конференции, многочисленные беседы, обзоры. Рассчитанные на большую аудиторию участников и слушателей или на маленькую студенческую группу они всегда имели успех. Проводилась большая методическая работа.

С 1971 г. библиотека института фактически являлась методическим центром для вузовских библиотек и библиотек средних специальных учебных заведений г. Читы. В 1983г. на базе библиотеки медицинского института была проведена Зональная научно-практическая конференция «Состояние и пути совершенствования обслуживания читателей в библиотеках вузов Восточной Сибири». Библиотекари вузов из Читы, Иркутска, Красноярска, Улан – Удэ, Хабаровска, Владивостока, Ленинграда, поделились опытом работы, наметили задачи и методы их выполнения. В 1987 г. библиотека института была утверждена руководителем областного методического объединения библиотек вузов и средних учебных заведений. В библиотеке не было штатного методиста, поэтому вся работа организовывалась и проводилась заведующей библиотекой О.М. Пономарь, заместителем заведующей библиотекой З.Д. Голобоковой и заведующими отделами К.П. Пчелинцевой, Т.П. Трухиной, С.Н. Ермаковой. Проводились научно-практические конференции и семинары на темы: «НОТ (научная организация труда) в библиотеке», «Совершенствование библиотечно-библиографического обслуживания читателей», «Организация и ведение картотеки книгообеспеченности», велись занятия «Школы молодого библиотекаря». Библиотекам вузов и техникумов оказывалась большая методическая помощь по внедрению новых библиотечных ГОСТов, составлению регламентирующей документации. Распространялся передовой опыт.

Значительные преобразования в работе библиотеки произошли в 90-е годы. В 1990 г. увеличиваются штаты, совершенствуются технологические процессы, статус отделов приобретают справочно-библиографический отдел и отдел комплектования и обработки. Одним из важнейших направлений деятельности библиотеки является полное и оперативное обеспечение учебного процесса. В связи с необходимостью объединения учебных абонементов младших и старших курсов, руководство вуза принимает решение о предоставлении отделу учебной литературы, нового просторного помещения в одном из корпусов общежития № 5. В 1991 г. открывает для читателей двери  отдел учебной литературы с единым для всех курсов и факультетов учебным абонементом и студенческим читальным залом на 50 мест. Учебная библиотека стала обеспечивать студентов всем комплексом литературы по предметам учебной программы: комплектами учебников и учебных пособий на семестр, литературой на цикловые занятия и экзамены, дополнительной литературой. Оперативное и компетентное библиотечно-библиографическое обслуживание, максимальное удовлетворение запросов читателей стало основным направлением деятельности библиотеки.

С 2004-2011 гг. руководила библиотекой Ирина Геннадьевна Кунгурова. С ее приходом изменились структура библиотеки и штатный состав, была проведена аттестация сотрудников, в библиотечные процессы внедряются средства компьютеризации и автоматизации, применяется новая автоматизированная библиотечно-информационная  система «ИРБИС-64», результатом которой стало создание электронного каталога, различных баз данных, используемых для информационного обслуживания читателей. С 2008 г. на  абонементе научной литературы внедрена автоматизированная книговыдача, в настоящее время автоматизированная книговыдача осуществляется и на учебном абонементе. Активно используются традиционные формы библиотечно-библиографического обслуживания: Дни информации, Дни кафедр, пропаганда книжного фонда, книжные выставки. Сегодня книжные выставки стали виртуальными, а консультирование читателей возможно в онлайн режиме через сайт академии, социальной сети в ВКонтакте и с помощью мессенджеров.

В сентябре 2012 г. библиотеку возглавила Татьяна Леонидовна Зенкова, кандидат философских наук. Под ее руководством  началась работа по созданию собственной электронно-библиотечной системы трудов сотрудников ЧГМА, совершенствуется электронный каталог, который стал доступен читателям с любой точки, где есть интернет в авторизованном доступе с просмотром полнотекстовой базы данных трудов сотрудников академии, также пополняется и модернизируется содержание раздела «научная библиотека» на сайте академии. Для читателей/пользователей периодически подключаются новые тестовые доступы к различным электронно-библиотечным системам и электронным ресурсам. В 2013 г. открылся электронный читальный зал.

Неоценимый вклад в развитие библиотеки внесли ее старейшие работники: О.М. Пономарь, К.П. Пчелинцева, В.В. Шитикова, Н.Я. Москалева, В.А. Рузанова, О.В. Вершинина, О.П. Лукина, В.П. Ногина, В.И. Новоселова, Л.Л. Ракова, С.Н.  Ермакова, Т.В. Ланцева, Н.В. Блинова, Н.Н. Евсеева. Безусловно, глубокой признательности заслуживают люди, которые отдают любимой работе всю свою энергию и душу: О.А. Кочева, Т.П.Трухина, Е.П. Москалева, И.В. Губанова, М.Н. Фаст, В.Х. Гурулева, Н.В. Мурзина, Н.А. Воронова, О.И. Илюхина, Н.В. Капустина, Н.М. Емельянова, Е.Б. Петрушенко, Я.И. Беломестнова.

Научная библиотека ЧГМА сегодня соответствует всем нормативным требованиям по организации работы библиотек высших учебных заведений. Все структурные подразделения библиотеки укомплектованы соответствующими фондами и оборудованием. Библиотека обладает всеми необходимыми информационными ресурсами для обеспечения учебного и научного процессов, содействию воспитательной работе в вузе.  Всеми структурными подразделениями ведётся непрерывная работа по мониторингу книгообеспеченности, повышению квалификации сотрудников и качества обслуживания, осваиваются новые технологии, формы работы, расширяется перечень предоставляемых услуг, повышается уровень комфортности обслуживания читателей / пользователей.

• Организует дифференцированное обслуживание читателей/пользователей в читальных залах, отделах обслуживания и других пунктах выдачи по единому читательскому билету.
• Бесплатно обеспечивает читателей/пользователей основными библиотечными услугами. Предоставляет читателям дополнительные платные виды услуг (согласно прейскуранту), перечень которых определяется правилами пользования научной библиотекой.
• Прививает навыки пользования и поиска информации, а также ее применения в учебном процессе и научной работе, умение ориентироваться в справочно-библиографическом аппарате библиотеки, информационных системах и базах данных. Организует для студентов и аспирантов занятия по основам информационной культуры, библиотековедению и библиографии.
• Осуществляет информационное обслуживание (включая мобильное обслуживание) читателей/пользователей, используя различные формы и методы: Дни информации, Дни кафедр и др., тематические выставки и выставки-просмотры литературы (в том числе виртуальные).
• Формирует библиотечный фонд в соответствии с федеральными государственными образовательными стандартами, учебными планами и тематикой научных исследований. Приобретает учебную, научную, периодическую, справочную, художественную литературу, другие виды изданий, базы данных, источники информации на электронных носителях.Определяет источники комплектования библиотечного фонда.
• Осуществляет подготовку и проведение массовых мероприятий согласно плану воспитательной работы вуза.
• Осуществляет мониторинг обеспеченности литературой учебного процесса с целью корректировки планов комплектования фонда, планирования выпуска литературы вузом и приведения в соответствие информационных потребностей читателей/пользователей и состава фонда.
• Организует учет, структурирование и размещение документных фондов, обеспечивает их сохранность, необходимый режим хранения, а при необходимости – реставрацию, консервацию и репродуцирование.
• Изымает и реализует документы из библиотечного фонда согласно порядку исключения документов, согласованному с заведующей научной библиотекой в соответствии с действующими нормативными и правовыми актами.
• Обеспечивает сохранность и легитимное использование электронных ресурсов.
• Обеспечивает сохранность и учет редких изданий, отражает их в сводных каталогах и базах данных в рамках региональных и федеральных программ сохранения и развития культурно-исторического наследия.
• Ведет систему библиотечных каталогов и картотек на традиционных и электронных носителях с целью многоаспектного содержательного раскрытия фондов.
• Проводит научно-исследовательскую, методическую работу (аналитическую, организационную, консультационную) по совершенствованию всех направлений деятельности научной библиотеки.
• Изучает и внедряет инновационный опыт, результаты научных исследований в практику работы. Проводит социологические, маркетинговые и другие исследования с целью изучения интересов читателей/пользователей, определения уровня их удовлетворенности библиотечным обслуживанием.
• Внедряет в практику работы передовые библиотечные технологии, обеспечивает компьютеризацию библиотечно-библиографических процессов и работы модулей АИБС «Ирбис 64».
• Организует систему повышения квалификации библиотечных работников. Создает и поддерживает систему мотивации и стимулирования, направленную на развитие творческого потенциала персонала, инновационную деятельность, эффективный и качественный труд.
• Ведет хозяйственную деятельность в целях расширения перечня предоставляемых читателям услуг и социально-творческого развития библиотеки при условии, что это не наносит ущерба основной деятельности.