История кафедры берет начало с 1971 года, когда был сформирован курс детской хирургии при кафедре факультетской, а затем госпитальной хирургии ЧГМИ. Первыми ассистентами стали А.Е. Пажитнов, Л.С. Муравко. В дальнейшем ассистентами курса работали О.П. Максимова, В.Г. Сапожников, Т.Г. Будажапова, Э.А. Кальнова. Клинической базой курса в то время были два отделения Областной клинической больницы им. В.И. Ленина: детской хирургии и детской травматологии и ортопедии. Относительно молодые коллективы отделений, курса детской хирургии решали насущные проблемы гнойной хирургии детского возраста, поздней диагностики врожденных дефектов опорно-двигательного аппарата.

С открытием педиатрического факультета в 1983 году курс детской хирургии был преобразован в кафедру с курсами травматологии и ортопедии, реанимации и интенсивной терапии, урологии детского возраста. Заведующей кафедрой назначена доцент Л.С. Муравко. Диссертационное исследование Л.С. Муравко посвящено оптимизации заживления гнойных ран. Она имеет авторское свидетельство на изобретение, несколько рационализаторских предложений, более 100 печатных трудов. С первых дней работы совместно с органами практического здравоохранения сотрудники кафедры принимают активное участие в развитии хирургической помощи детям Забайкалья, проводят большую организационно-методическую, лечебно-диагностическую, научную работу.

Большой вклад в изучение вопроса состояния иммунитета и гемостаза при перитоните, бактериальных деструкции легких и влиянии иммуномодуляторов на течение септических заболеваний у детей внесли ассистенты О.П. Максимова, Т.Г. Будажапова. Практическое значение их исследований трудно переоценить – принципы интенсивной терапии до сих пор лежат в основе программ лечения пациентов с гнойно-септической патологией. В 1988 году результаты исследования Т.Г. Будажаповой использованы Фармкомитетом МЗ СССР при составлении инструкции по применению тималина.

В 1982 году ассистент кафедры, к.м.н. В. Г. Сапожников впервые применил двухмерную эхографию у детей с переломами конечностей. Он – первый руководитель СНО кафедры. Студенты-кружковцы ежегодно участвовали в региональных и Всесоюзных студенческих конференциях, неоднократно получали поощрения и призовые места. В настоящее время профессор Сапожников В.Г. заведует кафедрой педиатрии Тульского ГМУ. 

С 1986 года после окончания целевой аспирантуры по детской хирургии в Государственном педиатрическом институте г. Ленинграда начали работать ассистентами С.Л. Дручкова, А.В. Цапп, А.Г. Сафронов. Доцент С.Л. Дручкова, заведующая учебной частью кафедры, детский хирург высшей квалификации, проводит большую учебную и организационно-методическую работу на кафедре и в клинике, курирует отделение гнойной хирургии, активно занимается совершенствованием методов диагностики и лечения детей с гнойно-септической патологией. Диссертационная работа С.Л. Дручковой была посвящена отдаленным последствиям и осложнениям хирургического лечения аноректальных пороков у детей, лечением которых она занималась долгие годы. Ассистент А.В. Цапп преподавал основы анестезиологии, реанимации и интенсивной терапии детского возраста, изучал осложнения при катетеризации центральных вен. В течение ряда лет курс урологии детского возраста преподавал к.м.н. А.Г. Сафронов, предметом диссертационного исследования которого являлась острая инвагинация кишечника у детей старшего возраста. Основы травматологии и ортопедии детского возраста на протяжении 1986-1992 гг. преподавал отличный специалист и педагог С.А. Маккавеев. Им внедрены в практику отделения травматологии и ортопедии ОДКБ различные методы лечения врожденного вывиха бедра, использование металла с памятью формы, но наиболее пристальное его внимание было обращено к хирургическому лечению болезни Пертеса. Продолжил работу на курсе травматологии и ортопедии детского возраста с 1994 года ассистент, к.м.н. Г.Р. Жгенти. Доцент Г.Р. Жгенти – автор 4 монографий и учебных пособий для врачей, студентов, имеет много публикаций в отечественной и зарубежной литературе. На основании научных публикаций в 1997 году Международной академией наук Сан-Марино Г.Р. Жгенти присвоена ученая степень доктора медицинских наук, а в последующем он успешно защитил докторскую диссертацию «Влияние полипептидов лимфатической системы на патогенез некротического панкреатита». В настоящее время д.м.н. Г.Р. Жгенти заведует отделением травматологии и ортопедии в г. Батуми. На протяжении всего периода существования кафедры в подготовке студентов и молодых специалистов активно помогали ведущие кадры клиники. В разные годы на кафедре работали по совместительству В.М. Бродский, И.А. Дорожкова, Н.Н. Прокопенко, А.А. Ли, Н.М. Степанова, Е.И. Яцеева, С.Г. Гаймоленко и другие.

 С 2004 года после защиты кандидатской диссертации «Патогенетическое обоснование применения гидроксиэтилкрахмала при операционном стрессе у детей» руководить кафедрой детской хирургии стал к.м.н., доцент С.Г. Гаймоленко. Опытный практический хирург, он более десяти лет возглавлял детское хирургическое отделение ОДКБ, приложил значительные усилия к совершенствованию хирургической помощи детям, развитию хирургии новорожденных, эндокринной, грудной и эндоскопической хирургии. В этом же году ассистентом кафедры стала к.м.н. Н.М. Степанова, которая, будучи практическим врачом, успешно защитила кандидатскую диссертацию «Неинвазивные критерии диагностики и прогноза бронхолегочной патологии у новорожденных, находящихся на ИВЛ» (2000 г.). Хирург высшей категории Н.М. Степанова активно осваивала новые технологии в диагностике и лечении пациентов с хирургической патологией, руководила студенческим научным кружком кафедры. В настоящее время Наталья Маратовна ассистент кафедры детской хирургии Иркутского ГМУ. 

С 2010 года ассистентом кафедры после окончания клинической ординатуры стал Мазин А.С. молодой перспективный педагог, хирург. В 2015 году на кафедру на должность ассистента принят Сущенко Р.А., техническая грамотность которого, мы надеемся, позволит активно внедрять и развивать новые технологии на кафедре и в клинике. Кафедра готовит клинических ординаторов и врачей-интернов по специальности «детская хирургия», проводит курсы усовершенствования специалистов по актуальным вопросам в хирургии детского возраста. Врачи детские хирурги, травматологи-ортопеды, реаниматологи, прошедшие подготовку на кафедре, работают во всех уголках России и СНГ.